Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMO7Q8WWI1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
LMO7Q8WWI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LMO7Q8WWI1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMO7Q8WWI1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMO7Q8WWI1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMO7Q8WWI1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms