Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C7orf43Q8WVR3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C7orf43Q8WVR3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C7orf43Q8WVR3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C7orf43Q8WVR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms