Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
U2AF1L4Q8WU68 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
U2AF1L4Q8WU68 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms