Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3BQ8TF42 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBASH3BQ8TF42 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBASH3BQ8TF42 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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