Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SAP25Q8TEE9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SAP25Q8TEE9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms