Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPBAR1Q8TDU6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPBAR1Q8TDU6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms