Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRSK1Q8TDC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRSK1Q8TDC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms