Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK9Q8TD19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK9Q8TD19 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms