Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA6DQ8NFY4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA6DQ8NFY4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms