Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BEST4Q8NFU0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms