Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LPCAT1Q8NF37 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LPCAT1Q8NF37 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms