Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf47Q8NEP4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C17orf47Q8NEP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C17orf47Q8NEP4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms