Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC150Q8NCX0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC150Q8NCX0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC150Q8NCX0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.3 ms