Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDPRQ8NCN5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDPRQ8NCN5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDPRQ8NCN5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDPRQ8NCN5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms