Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUMF1Q8NBK3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUMF1Q8NBK3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms