Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC89Q8N998 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC89Q8N998 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms