Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPA2Q8N8Q9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIPA2Q8N8Q9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NIPA2Q8N8Q9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms