Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00337Q8N6G1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms