Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRACR2BQ8N4Y2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRACR2BQ8N4Y2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CRACR2BQ8N4Y2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms