Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHTF2Q8N3S3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF2Q8N3S3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHTF2Q8N3S3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF2Q8N3S3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms