Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

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Length 1,253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA5B2Q8N398 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VWA5B2Q8N398 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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