Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.821e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-205ENST00000431834 1612 ntTSL 530.4■■■□□ 2.461e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.581e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-209ENST00000457960 881 ntTSL 522■■□□□ 1.111e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-212ENST00000477331 1041 ntTSL 219.53■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-208ENST00000455389 1431 ntTSL 319.35■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-206ENST00000432186 905 ntTSL 216.61■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-215ENST00000495017 2125 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-207ENST00000432916 1430 ntTSL 215.77■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 PRR5-214ENST00000492475 920 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 37.4
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AGGF1Q8N302 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 37.4
AGGF1Q8N302 ARRB1-211ENST00000533255 551 ntTSL 211.32□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 37.4
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AGGF1Q8N302 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 37.2
AGGF1Q8N302 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 37.2
AGGF1Q8N302 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 37.2
AGGF1Q8N302 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 37.2
AGGF1Q8N302 CSMD1-201ENST00000335551 12134 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 37.2
AGGF1Q8N302 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 37.2
AGGF1Q8N302 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 37
AGGF1Q8N302 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 36.9
AGGF1Q8N302 FAM239A-201ENST00000381108 2198 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.626e-13■■■■■ 36.7
AGGF1Q8N302 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.637e-9■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.167e-9■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 PPP2R2C-201ENST00000314348 579 ntTSL 412.88□□□□□ -0.357e-9■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-206ENST00000538646 1649 ntTSL 1 (best)22.42■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-209ENST00000541924 1594 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-203ENST00000402929 3002 ntTSL 217.14■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 36.6
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AGGF1Q8N302 HNF1A-213ENST00000544574 725 ntTSL 1 (best)14.99□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 HNF1A-204ENST00000535955 434 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 RERE-210ENST00000468247 414 ntTSL 220.15■□□□□ 0.821e-15■■■■■ 36.6
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AGGF1Q8N302 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.293e-10■■■■■ 36.6
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AGGF1Q8N302 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.983e-10■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 MCF2L2-212ENST00000488149 7813 ntTSL 28.86□□□□□ -0.993e-10■■■■■ 36.6
AGGF1Q8N302 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.453e-10■■■■■ 36.6
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AGGF1Q8N302 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 36.4
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AGGF1Q8N302 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.056e-12■■■■■ 36.3
AGGF1Q8N302 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.386e-12■■■■■ 36.3
AGGF1Q8N302 DYM-205ENST00000577734 588 ntTSL 38.4□□□□□ -1.066e-12■■■■■ 36.3
AGGF1Q8N302 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.854e-28■■■■■ 36.3
AGGF1Q8N302 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 210.49□□□□□ -0.736e-16■■■■■ 36.2
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AGGF1Q8N302 DOCK8-202ENST00000382331 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 36.2
AGGF1Q8N302 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 36.2
AGGF1Q8N302 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 36.2
AGGF1Q8N302 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 36.2
AGGF1Q8N302 DOCK8-216ENST00000495184 9277 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 36.2
AGGF1Q8N302 PARP10-207ENST00000526007 2179 ntTSL 1 (best)22.66■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 35.9
AGGF1Q8N302 PARP10-209ENST00000527262 3027 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 35.9
AGGF1Q8N302 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 35.9
AGGF1Q8N302 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 35.9
AGGF1Q8N302 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 35.9
AGGF1Q8N302 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.542e-15■■■■■ 35.9
AGGF1Q8N302 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-15■■■■■ 35.9
AGGF1Q8N302 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.266e-12■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 ADARB2-204ENST00000469464 1741 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.345e-9■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.365e-9■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 DLEU1-218ENST00000475913 534 ntTSL 1 (best)11.95□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 DLEU1-232ENST00000491341 1141 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.555e-9■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.565e-9■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.585e-9■■■■■ 35.8
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