Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00269Q8N2A0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00269Q8N2A0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00269Q8N2A0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00269Q8N2A0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms