Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CA13Q8N1Q1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA13Q8N1Q1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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