Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D3Q8IZS8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms