Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC13Q8IYE1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC13Q8IYE1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms