Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM48Q8IWZ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM48Q8IWZ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms