Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNJLQ8IV13 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNJLQ8IV13 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJLQ8IV13 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJLQ8IV13 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJLQ8IV13 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJLQ8IV13 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJLQ8IV13 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJLQ8IV13 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJLQ8IV13 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJLQ8IV13 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJLQ8IV13 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.7 ms