Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms