Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUK5

PLXDC1, Plexin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1Q8IUK5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLXDC1Q8IUK5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXDC1Q8IUK5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXDC1Q8IUK5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms