Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX29P2Q8IUI4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX29P2Q8IUI4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms