Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM17Q86X19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM17Q86X19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM17Q86X19 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms