Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETREG3Q86VR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RETREG3Q86VR2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms