Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRTM3Q86VH5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRTM3Q86VH5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRTM3Q86VH5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms