Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALYREFQ86V81 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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