Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRX1Q86UT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRX1Q86UT6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NLRX1Q86UT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms