Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX20Q7Z614 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms