Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRAPQ7Z569 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRAPQ7Z569 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRAPQ7Z569 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRAPQ7Z569 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms