Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE3BQ7Z3V4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBE3BQ7Z3V4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBE3BQ7Z3V4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE3BQ7Z3V4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE3BQ7Z3V4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE3BQ7Z3V4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms