Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRC3Q7RTR2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NLRC3Q7RTR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRC3Q7RTR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms