Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRADAQ7RTN6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRADAQ7RTN6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms