Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHST3Q7LGC8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHST3Q7LGC8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHST3Q7LGC8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHST3Q7LGC8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHST3Q7LGC8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHST3Q7LGC8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHST3Q7LGC8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHST3Q7LGC8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHST3Q7LGC8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHST3Q7LGC8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms