Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARCQ7LC44 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARCQ7LC44 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms