Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPGS1Q6ZTW0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPGS1Q6ZTW0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPGS1Q6ZTW0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms