Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSZ5

ARHGEF18, Rho guanine nucleotide exchange factor 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF18Q6ZSZ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGEF18Q6ZSZ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF18Q6ZSZ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF18Q6ZSZ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF18Q6ZSZ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF18Q6ZSZ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF18Q6ZSZ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF18Q6ZSZ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF18Q6ZSZ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF18Q6ZSZ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms