Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC55Q6ZSA7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC55Q6ZSA7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC55Q6ZSA7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRC55Q6ZSA7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC55Q6ZSA7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms