Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC129Q6ZRS4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC129Q6ZRS4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms