Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT7Q6ZNI0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCNT7Q6ZNI0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCNT7Q6ZNI0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCNT7Q6ZNI0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms