Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB5

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZNB5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q6ZNB5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q6ZNB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q6ZNB5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms