Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP12Q6UXS9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP12Q6UXS9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms